Evaluación de marcadores moleculares en la identificación de especies de Alternaria

Abstract

Las especies del género Alternaria, uno de los principales patógenos de plantas en el mundo, son difíciles de identificar debido a su plasticidad fenotípica. En este estudio se identificaron algunas de las especies de Alternaria presentes en la sabana de Bogotá usando un enfoque morfológico, además se evaluó el potencial de cuatro regiones genéticas como potenciales marcadores taxonómicos tipo BARCODE de Alternaria, el alergeno mayor de Alternaria (Alta a1), el gen de la oxidasa alternativa (AOX), el gen de la citocromo oxidasa I (COX1) y la región del espaciador de transcrito interno (ITS). Se identificaron 14 especies de Alternaria, todas ellas pertenecientes a la sección de conidios pequeños, 10 de las cuales corresponden a la sección alternata. A partir de las descripciones morfológicas realizadas se presenta una clave taxonómica para las especies de Alternaria de la sabana de Bogotá. Ninguna de los cuatro marcadores evaluados presenta características de Barcode para las especies integradas al estudio, debido principalmente a la cercanía filogenética que existe entre ellas. A pesar de la posibilidad de separar los aislados obtenidos en morfoespecies a partir de las características difusas de sus conidios y de su patrón de conidiación, el sustento genético referido a la diversidad de las secuencias para estos cuatro marcadores es insuficiente para designar como especies a los aislados pertenecientes a la sección alternata. Se propone que los taxones dentro de la sección alternata sean considerados como variantes intraespecíficas dentro del género.